После войны с декабря 1946 года Федор Алексеевич работал в Наркомате местной топливной промышленности БССР. Сбылось то, о чем он мечтал: занялся наукой.
В 1950 году окончил аспирантуру при Институте торфа Академии Наук БССР и стал кандидатом технических наук.
С 1951 года - старший научный сотрудник Института торфа Академии Наук БССР.
Его научная деятельность долгие годы была посвящена рациональному использованию природного богатства республики - торфа в сельском хозяйстве для повышения плодородия легких почв.
Научные труды Федора Алексеевича включают более 120 статей, 2 монографии и авторские свидетельства на изобретения.
Открытия Малышева до сих пор применяются в Беларуси и за рубежом для повышения плодородия почв.
В ГУО «Средняя школа № 48 г.Минска» сложилась добрая традиция принимать в ряды общественной организации БРПО у памятной мемориальной доски самых достойных учащихся школы и сегодняшний день не исключение.
